Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMSAP2Q08AD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMSAP2Q08AD1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms