Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX6P78412 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX6P78412 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX6P78412 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX6P78412 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms