Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT85P78386 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT85P78386 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT85P78386 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT85P78386 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT85P78386 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT85P78386 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT85P78386 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms