Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM193AP78312 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms