Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms