Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK11BP21127 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms