Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTLA4P16410 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms