Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACADSP16219 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACADSP16219 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms