Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFAP15692 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms