Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C4BP0C0L5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C4BP0C0L5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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