Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms