Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNSO60931 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms