Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALUO43852 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALUO43852 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALUO43852 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALUO43852 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALUO43852 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALUO43852 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALUO43852 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms