Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APAF1O14727 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APAF1O14727 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APAF1O14727 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APAF1O14727 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APAF1O14727 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APAF1O14727 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms