Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L7N2F9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L7N2F9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
L7N2F9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
L7N2F9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
L7N2F9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms