Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ15

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ15 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BQ15 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BQ15 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BQ15 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BQ15 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms