Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E9PMD0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E9PMD0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E9PMD0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E9PMD0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E9PMD0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E9PMD0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms