Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF215Q9Y6U7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF215Q9Y6U7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF215Q9Y6U7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF215Q9Y6U7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms