Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N5

SQOR, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQORQ9Y6N5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SQORQ9Y6N5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SQORQ9Y6N5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SQORQ9Y6N5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SQORQ9Y6N5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SQORQ9Y6N5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms