Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PARP3Q9Y6F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PARP3Q9Y6F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PARP3Q9Y6F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PARP3Q9Y6F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PARP3Q9Y6F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP3Q9Y6F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PARP3Q9Y6F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PARP3Q9Y6F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms