Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00312Q9Y6C7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00312Q9Y6C7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms