Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y675

SNURF, SNRPN upstream reading frame protein, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNURFQ9Y675 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNURFQ9Y675 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNURFQ9Y675 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNURFQ9Y675 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNURFQ9Y675 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms