Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54BQ9Y620 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD54BQ9Y620 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD54BQ9Y620 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD54BQ9Y620 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD54BQ9Y620 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms