Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H9

PCDHA2, Protocadherin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA2Q9Y5H9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHA2Q9Y5H9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHA2Q9Y5H9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHA2Q9Y5H9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCDHA2Q9Y5H9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHA2Q9Y5H9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHA2Q9Y5H9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms