Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPRKBQ9Y3C4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRKBQ9Y3C4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRKBQ9Y3C4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRKBQ9Y3C4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRKBQ9Y3C4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRKBQ9Y3C4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms