Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAB39Q9Y376 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAB39Q9Y376 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAB39Q9Y376 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAB39Q9Y376 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms