Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A8Q9Y2E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A8Q9Y2E8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A8Q9Y2E8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A8Q9Y2E8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms