Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN6Q9UQ52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN6Q9UQ52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN6Q9UQ52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN6Q9UQ52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN6Q9UQ52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms