Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AGTPBP1Q9UPW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AGTPBP1Q9UPW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
AGTPBP1Q9UPW5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms