Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAF8Q9UPN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAF8Q9UPN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SCAF8Q9UPN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCAF8Q9UPN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCAF8Q9UPN6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms