Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TTF2Q9UNY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TTF2Q9UNY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TTF2Q9UNY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TTF2Q9UNY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TTF2Q9UNY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms