Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDARQ9UNE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EDARQ9UNE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDARQ9UNE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDARQ9UNE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDARQ9UNE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms