Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML1Q9UN30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML1Q9UN30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCML1Q9UN30 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML1Q9UN30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML1Q9UN30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms