Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF1Q9UMS5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHTF1Q9UMS5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms