Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZMYND8Q9ULU4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND8Q9ULU4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND8Q9ULU4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND8Q9ULU4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZMYND8Q9ULU4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms