Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB23Q9ULC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB23Q9ULC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB23Q9ULC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB23Q9ULC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms