Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXL4Q9UKA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXL4Q9UKA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXL4Q9UKA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXL4Q9UKA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms