Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMPXQ9UHP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMPXQ9UHP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMPXQ9UHP9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMPXQ9UHP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms