Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXTL2Q9UBQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXTL2Q9UBQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL2Q9UBQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms