Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC3IPQ9P2W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC3IPQ9P2W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMC3IPQ9P2W1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMC3IPQ9P2W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMC3IPQ9P2W1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms