Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT1Q9P2V4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIT1Q9P2V4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIT1Q9P2V4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIT1Q9P2V4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIT1Q9P2V4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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