Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC59Q9P031 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC59Q9P031 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC59Q9P031 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC59Q9P031 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms