Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MSRB1Q9NZV6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MSRB1Q9NZV6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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