Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ARHGEF12Q9NZN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARHGEF12Q9NZN5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGEF12Q9NZN5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARHGEF12Q9NZN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGEF12Q9NZN5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms