Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK12Q9NYV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CDK12Q9NYV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CDK12Q9NYV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CDK12Q9NYV4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK12Q9NYV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK12Q9NYV4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK12Q9NYV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
CDK12Q9NYV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms