Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZDHHC3Q9NYG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC3Q9NYG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZDHHC3Q9NYG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms