Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO1C1Q9NYB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO1C1Q9NYB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms