Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A1Q9NY26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A1Q9NY26 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A1Q9NY26 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC39A1Q9NY26 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms