Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALKBH4Q9NXW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH4Q9NXW9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH4Q9NXW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH4Q9NXW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms