Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDKN2AIPQ9NXV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKN2AIPQ9NXV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDKN2AIPQ9NXV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDKN2AIPQ9NXV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms